Les collections de manuscrits de la Bibliothèque comprennent plus de 7 620 manuscrits originaux et plus de 700 copies sur papier ou microfilm, y compris des reproductions réalisées entre autres par l'Institut d'histoire des sciences arabes et islamiques de l'Université de Francfort. Les manuscrits originaux ont été catalogués et enregistrés informatiquement, et la bibliothèque a publié quatre index à ce jour, tandis que l'élaboration des index restants est en cours.
Afin d'exprimer son intérêt pour les manuscrits, de contribuer à la préservation et à la protection du patrimoine arabe et islamique, et de le mettre à la disposition des éditeurs et des passionnés de ce domaine, la Bibliothèque a créé la Section des Manuscrits, qui a ouvert ses portes en 1988. La Bibliothèque s'efforce de numériser l'ensemble de ses manuscrits et a rassemblé plus de deux millions d'images, qui ont été copiées sur CD-ROM et intégrées sur le site de la bibliothèque numérique arabe afin d'en faciliter l'accès pour tous.
Les documents rares de la bibliothèque comprennent des manuscrits enluminés à l'or et des exemplaires du Coran. De plus, il existe un certain nombre de manuscrits qui n'ont jamais été imprimés ni étudiés selon les sources que nous avons consultées, et qui attendent l'attention des chercheurs, des historiens et des spécialistes pour être sortis de l'oubli et mis en lumière.
Dans le cadre du renforcement de ses relations avec les usagers de l'ensemble de ses collections, la Bibliothèque publique Roi Abdul-Aziz est heureuse d'assister les chercheurs et les enquêteurs, et les invite à consulter les manuscrits disponibles à la Bibliothèque et à y obtenir ce dont ils ont besoin. Parallèlement, la Bibliothèque se charge, au nom des chercheurs, de demander des copies de manuscrits nécessaires auprès d'autres bibliothèques à l'intérieur ou à l'extérieur du Royaume. Elle annonce également l'acceptation des dons de manuscrits, tout en proposant un service d'échange scientifique avec d'autres bibliothèques et chercheurs sérieux, permettant à un chercheur de choisir une version papier ou microfilm de l'une de ses collections en échange d'un autre manuscrit que la Bibliothèque ne possède pas encore.

