La bibliothèque a acquis de prestigieuses collections de livres rares avec des éditions uniques en termes de valeur scientifique ou historique. Elles totalisent plus de 32 625 titres uniques, tant par leur édition que par leur sujet, et sont toutes mises à la disposition des chercheurs et des personnes intéressées.
Les livres rares s'inscrivent dans l'intérêt et la politique de la Bibliothèque visant à préserver le patrimoine imprimé arabe dans les différents domaines de la science et de la connaissance. Ces livres rares comprennent :
1. Une collection d'éditions européennes rares
La Bibliothèque a acquis une collection d'éditions européennes anciennes et rares, ainsi que 78 livres rares sur la vie du prophète Mahomet et 113 traductions du Saint Coran dans des langues européennes anciennes, en plus de 55 livres sur les études coraniques et 54 livres relatifs aux sources islamiques. Ceux-ci représentent les débuts de l'intérêt européen pour le Saint Coran et les études coraniques.
La Bibliothèque a également acquis une collection d'éditions arabes imprimées en Europe en 1592-1593. Celles-ci s'inscrivent dans le grand intérêt de la Bibliothèque pour le patrimoine original arabe et islamique et comprennent des livres très rares tels que : Le Livre de la Loi (Al-Qanun) d'Ibn Sina ; Les Secrets de l'éloquence (Asrar al-Balagha) d'Abdul-Qadir al-Jirjani, édité par H. Reiter ; Hawliyat Nashr al-Mathani (Une chronologie des événements à Fès), composé par Bilyunis Al-Hakim, édité par Osla Weiser ; un commentaire sur le Livre de Risaghuji (Kitab Risaghuji) par Abu al-Faraj Ibn al-Tayeb, édité par Kwami Jiki ; La Science islamique de l'astronomie (‘Ilm al-Hay’a al-Islami), composé par Jalal al-Din al-Suyuti, édité par Anton M. Hayinin ; La Fabrication du plus grand remède (Making the Greatest Medicine), par Jabbar Ibn Hayyan, édité par Pierre Laurie, en plus de 1 560 livres rares en français et en anglais.
2. Une collection d'éditions arabes rares
Cette collection comprend 9 750 titres de livres arabes rares, indexés, classés et saisis dans la base de données d'informations sur les livres arabes.
3. Une collection de bibliothèques privées
La bibliothèque possède également un ensemble de bibliothèques privées qu'elle a pu acquérir grâce au soutien de son fondateur, le roi Abdallah ben Abdelaziz, et ajouter au nombre croissant de collections acquises, en particulier celles contenant les documents les plus rares sur le Royaume d'Arabie saoudite, la péninsule Arabique et les pays arabes en général, notamment :
A. La bibliothèque George Rentz
Il s'agit de la bibliothèque de l'orientaliste américain George Rentz. Elle comprend de nombreux livres, manuscrits, cartes et documents rares en arabe, ainsi qu'environ 3 265 livres en langues étrangères qui traitent des événements politiques, historiques et géographiques les plus importants d'Arabie saoudite et du Golfe arabe. Contemporain du roi Abdelaziz Al Saoud, il a vécu la Seconde Guerre mondiale, la création de la Ligue arabe, la démarcation des frontières dans la péninsule Arabique et le début de la production pétrolière (1945-1963).
B. La bibliothèque Hamza Abu Bakr
Hamza Abu Bakr était le doyen de l'Institut islamique et anciennement imam de la Mosquée de Paris. Sa bibliothèque contient 21 700 titres répartis dans 19 821 volumes de livres, périodiques, journaux, manuscrits, documents et coupures de presse, des études et des livres importants et rares en arabe, français, anglais, allemand et russe, couvrant divers domaines des sciences juridiques, littéraires, politiques et médicales, de la littérature de voyage, du patrimoine national et religieux, et des relations humaines. Les livres de cette bibliothèque peuvent être classés comme suit :
- Livres rares sur des sujets importants en arabe (9 750).
- Livres très rares en français, en cours de catalogage et de classification.
- Livres d'études algériennes et marocaines dans divers domaines écrits en français.
- Collections de dictionnaires et d'encyclopédies.
- Collections de périodiques, journaux et magazines français, certains remontant au XIXe siècle, aux guerres mondiales et à des événements marquants jusqu'en 1986.
C. Collections de sources multiples
La bibliothèque comprend des collections distinguées traitant des sciences de la charia et des sciences humaines, de la littérature de voyage, ainsi que des descriptions de pays, de leur patrimoine, de leurs coutumes et de leurs traditions. Ces groupes sont d'une grande importance pour les chercheurs afin de les étudier et d'en tirer profit.

